| 順位 | チーム名 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 1 | 長崎大附属 | 44:14 | |
| 2 | 西泊 | 45:40 | |
| 3 | 三重 | 45:54 | |
| 4 | 東長崎 | 46:58 | |
| 5 | 琴海 | 47:29 | |
| 6 | 桜馬場 | 47:49 | |
| 7 | 山里 | 48:23 | |
| 8 | 三和 | 48:27 | |
| 9 | 福田 | 49:11 | |
| 10 | 橘 | 49:25 | |
| 11 | 戸町 | 49:50 | |
| 12 | 梅香崎 | 49:52 | |
| 13 | 日見 | 49:54 | |
| 14 | 長崎東 | 50:25 | |
| 15 | 大浦 | 50:41 | |
| 16 | 横尾 | 51:32 | |
| 17 | 小島 | 51:57 | |
| 18 | 小江原 | 53:06 | |
| 19 | 淵 | 53:14 | |
| 20 | 片淵 | 53:21 | |
| 21 | 小ヶ倉 | 53:32 | |
| 22 | 土井首 | 57:06 |