| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 720 | ヨコタ カイト 横田 海斗 (1) | 小長井 | 4:34.91 | |
| 2 | 1268 | ウチダ リョウタ 内田 涼太 (1) | 西諫早 | 4:38.21 | |
| 3 | 782 | ヨコオ ハルキ 横尾 悠稀 (1) | 森山 | 4:46.54 | |
| 4 | 1255 | ナカガワ ヒトシ 中川 仁 (1) | 西諫早 | 4:48.40 | |
| 5 | 774 | コジマ タイセイ 小島 大征 (1) | 森山 | 4:58.83 | |
| 6 | 1213 | シバハラ キスイ 柴原 祈彗 (1) | 長崎日大 | 4:59.30 | |
| 7 | 1249 | ナカヤ ユウト 中屋 悠人 (1) | 明峰 | 5:02.18 | |
| 8 | 809 | スズキ カイセイ 鈴木 快青 (1) | 諫早高附属 | 5:12.82 | |
| 9 | 1248 | マツオ ユウホ 松尾 侑歩 (1) | 明峰 | 5:15.20 | |
| 10 | 1285 | クサノ リク 草野 梨駆 (1) | 北諫早 | 5:19.97 | |
| 11 | 1043 | キハラ サトシ 木原 惺 (1) | 真城 | 5:32.68 | |
| 12 | 1288 | ナカシマ ケンタ 中島 健太 (1) | 北諫早 | 5:43.20 |