| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 282 | ドイ トモキ 土井 智輝 (2) | 西浦上 | 4:36.69 | |
| 2 | 539 | ミヤムラ ユウセイ 宮村 優誠 (2) | 大瀬戸 | 4:44.21 | |
| 3 | 279 | カワグチ ヒカル 川口 輝 (2) | 西浦上 | 4:49.12 | |
| 4 | 42 | モリタ ハルマ 森田 晴真 (2) | 東長崎 | 4:57.21 | |
| 5 | 1048 | クワノ エイスケ 桒野 英佑 (2) | 緑が丘 | 4:57.50 | |
| 6 | 446 | マツオ リュウビ 松尾 龍飛 (2) | 長崎 | 5:00.61 | |
| 7 | 675 | ノグチ ユウマ 野口 優真 (2) | 山里 | 5:02.22 | |
| 8 | 407 | ハヤシ ユウタ 林 祐太 (2) | 長崎東 | 5:05.62 | |
| 9 | 341 | トモシゲ タイセイ 朝重 太晴 (2) | 青雲 | 5:06.24 | |
| 10 | 340 | クボキ アキノリ 久保木亮敬 (2) | 青雲 | 5:07.91 | |
| 11 | 414 | シゲマツ タイセイ 重松 大星 (2) | 土井首 | 5:08.94 | |
| 12 | 580 | サトウ ハクト 佐藤 珀斗 (2) | 琴海 | 5:10.35 | |
| 13 | 919 | ヤマシタ シュンキ 山下 俊輝 (2) | 西浦上 | 5:11.99 | |
| 14 | 215 | フクシマ エイジ 福島 瑛二 (2) | 滑石 | 5:12.26 | |
| 15 | 44 | スエマツ リク 末松 陸 (2) | 東長崎 | 5:19.32 | |
| 16 | 1253 | セキノ ユウタ 関野 裕太 (2) | 青雲 | 5:30.92 | |
| 17 | 708 | ヤナガ シュウセイ 弥長 周世 (2) | 桜馬場 | 5:35.19 | |
| 18 | 409 | ミヤザキ イッシン 宮崎 壱心 (2) | 長崎東 | 5:36.33 | |
| 19 | 473 | コダマ ユウリ 小玉 侑利 (2) | 三重 | 5:38.06 | |
| 20 | 544 | イワモト ヤマト 岩本 大和 (2) | 大瀬戸 | 5:43.95 | |
| 21 | 525 | キムラ リュウト 木村 琉翔 (2) | 横尾 | 5:50.51 | |
| 22 | 555 | モリシタ ユキト 森下 志翔 (2) | 小ヶ倉 | 5:56.86 | |
| 23 | 408 | マツオ タイチ 松尾 泰知 (2) | 長崎東 | 6:40.42 |